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UG环球客户端:警惕!北京新冠病例现D614G突变,感染力或增强近10倍!

2020-06-24 14:02 出处:辽源新闻  人气:   评论( 0

导语:新发地溯源迷雾重重,漏网之鱼不可避免,全国各地都有可能再次拉起警报。



摄图网


近期北京疫情因“新发地”相关多个聚集病例事件,出现疫情“小高峰”,受到全国关注。一方面是由于“新发地”在疫情爆发前10天,有超过百万人去过“新发地”,这些人群中,被感染的人员可能带来非常大的不确定风险。另外,不管是“物传人”还是“人传人”问题还尚不清楚,海鲜市场与百事厂区出现多人聚集性病例事件,引发公众对海鲜等冷冻食品、可乐、薯片等安全性的担忧。


北京市卫生健康委22日通报,21日0时至24时,北京市新增报告本地新冠肺炎确诊病例9例、疑似病例2例、无症状感染者5例,6月11日以来,北京市累计报告本地新冠肺炎确诊病例236例,在院236例,尚在观察的无症状感染者22例。并有天津、河北、浙江、辽宁、四川多地发现超过20例的北京关联病例,相关传播溯源工作难度上升。



新发地与华南海鲜市场、中央公园面积比较,reuters.


中国疾控中心病毒病所专家先后在6月14日和15日、17日,3次进入新发地农产品批发市场,采集了数百份样本,发现有不少阳性样本,这些阳性环境样本可以帮助研究者还原“案发现场”,锁定传染范围甚至传染源。专家倾向认为,“人传人”与“物传人”都可能发生,是物品或人将北京之外的新冠病毒带入了“新发地”。



“新型冠状病毒国家科技资源服务系统”http://nmdc.cn/nCoV


6月18日晚间,中国疾控中心已通过“新型冠状病毒国家科技资源服务系统”正式发布2020年6月北京新发地新冠疫情及病毒基因组序列数据。主要包括北京市确诊病例基因组序列数据(NMDC60013902-01、NMDC60013903-02)以及环境样本基因组序列数据(NMDC60013903-03),这3个样本均采集于2020年6月11日,为近期北京爆发的病毒样本。同时中国疾控中心也向世界卫生组织及全球共享流感数据倡议组织(GISAID)提交了新冠疫情及病毒基因组序列数据,以全球共享数据。




nextstrain网站展示北京样本基因组序列数据位置,https://nextstrain.org/ncov


比对此前数据发现,最近发布的北京爆发3组序列病毒样本均存在D614G突变,并落在同一个进化簇中,该进化簇中多为欧洲病例样本,与前期采样的3个输入型的病毒的基因序列很不一样,在全球冠状病毒的进化架构中,和这3个北京的新冠病毒序列最接近的为来自中国台湾、希腊和葡萄牙的新近发布的新冠序列。



bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.14.151357



D614G流行变异情况,The D614G mutation of SARS-CoV-2 spike protein enhances viral infectivity and decreases neutralization sensitivity to individual convalescent sera,doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.20.161323


具有D614G突变的毒株于2月初开始在欧洲传播,到5月成为世界范围内的主流毒株,在欧洲和北美占近70%的测序样本。在印度,巴西、伊朗等地均有发现。



The D614G mutation in the SARS-CoV-2 spike protein reduces S1 shedding and increases infectivity,bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.12.148726


美国斯克里普斯研究所(Scripps Research)病毒学家Hyeryun Choe团队在预印本网站bioRxiv文章称发表最新研究表明,在整个欧洲和美国流行的 SARS-CoV-2变异体中的微小基因突变,有可能增加冠状病毒上刺突蛋白的数量,这将大大提高了该病毒感染力,其感染人细胞的能力提高9-10倍。



D614G突变与感染力增强有关,bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.12.148726


SARS-CoV-2分离株编码病毒中的D614G突变随时间推移,峰值(S)蛋白在发现它的位置上占主导地位,这表明这种变化增强了病毒的传播。Hyeryun Choe团队比较了功能残基上带有天冬氨酸(SD614)和甘氨酸(SG614)的S蛋白的特性,观察到以SG614伪病毒感染的逆转录病毒感染了ACE2表达细胞比使用SD614的细胞明显更有效。使用类似病毒SARS-CoV-2 M,N,E和S蛋白的方法获得了类似的结果,SG614确实做到了不能比SD614更有效地结合ACE2,并且包含这些S的伪病毒康复期血浆以可比的效率中和蛋白质。这些结果表明SG614比SD614更稳定,这与流行病学一致数据表明带有SG614的病毒可以更有效地传播。



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    本文标签: |新冠突变|

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